上周五本来已经配置完成的NIS服务竟然又出现了bug，无语了

No passwd entry for user 'test01'

在niss配置文件里加东西。已在前边的博客中注明。

 

今天配置MPI

Ubuntu 安装 OpenMPI

1. 下载OpenMPI

在官网上下载最新版本的安装包

2. 解压并进行配置

tar -zxvf openmpi-4.0.1tar.gz
cd openmpi-4.0.1
./configure --prefix="/usr/local/openmpi"

注意最后一行是将其安装到 /usr/local/openmpi目录下，可以指定为其他目录，如，用户目录下。

然后安装出现依赖包没有的状况
需要安装以下依赖包：

sudo apt install build-essential

3. Build 并安装

make
sudo make install

可以在make后加参数-j8, 表示用8核编译

4. 添加环境变量

在.bashrc文件中添加下列几行

vim  ~/.bashrc 
export PATH="$PATH:/usr/local/openmpi/bin"
export LD_LIBRARY_PATH="$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/openmpi/lib/"

保存后，执行

source ~/.bashrc  

sudo ldconfig

5. 测试是否安装成功

cd examples/

会出现系统不建议在root下运行的警告，需要带下边的命令

mpirun  --allow-run-as-root  hello_c

MPI编译器是对底层编译器的一层包装，通过-show参数可以查看实际使用的编译器。比如：

mpicc -show

补充：运行MPI程序
OpenMPI使用自带的OpenRTE进程管理器，启动命令为mpirun/mpiexec/orterun，基本格式如下： 

mpirun -np N -hostfile <filename> <program>

 -np N：运行N个进程

 -hostfile：指定计算节点，文件格式如下：

node1 slots=8

node2 slots=8

slots=8代表可在该节点上执行8个进程，也可将node1和node2分别写8行。

集群： 

压缩包在共享目录中，节点2和3进行如上安装和配置

以下是测试代码：

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>

int main(int argc, char** argv) {
    // Initialize the MPI environment
    MPI_Init(NULL, NULL);

    // Get the number of processes
    int world_size;
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);

    // Get the rank of the process
    int world_rank;
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);

    // Get the name of the processor
    char processor_name[MPI_MAX_PROCESSOR_NAME];
    int name_len;
    MPI_Get_processor_name(processor_name, &name_len);

    // Print off a hello world message
    printf("Hi from processor %s, rank %d out of %d processors\n",
           processor_name, world_rank, world_size);

    // Finalize the MPI environment.
    MPI_Finalize();
}

节点1运行：

mpirun -np 3 --allow-run-as-root --prefix /usr/local/openmpi -host ubuntu1,ubuntu2,ubuntu3 ./main

结果：

 

明天配置负载均衡 SGE或者 PBS