报错

长话短说，就是最近在使用Seurat ，patachwork 画图的时候出现了报错，比如执行：

# Seurat 画图
DimPlot(filtered_obj, group.by = "orig.ident", reduction = "umap", label = FALSE)
VlnPlot(scRNAlist[[i]], features = c("nFeature_RNA"))
# 或者
p1 + p2

会出现报错：

Error in Ops.data.frame(guide_loc, panel_loc) :
‘==’ only defined for equally-sized data frames

解决

需要尝试三种方案：

  • 更新 patachwork：devtools:install_github("thomasp85/patchwork")
  • ggplot2 版本降级，从 3.5.1 降到 3.5.0，devtools::install_version("ggplot2", version = "3.5.0")
  • 直接更新一下Seurat，但是不想使用V5版本的就不要考虑了
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